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Les Annotationes in Johannem de 1523 font partie intégrante du corpus exégétique de la Réforme, et sont, à ce titre, éclairées du point de vue de leurs sources (patristiques, médiévales, humanistes), de l'influence de Luther (théologique et sot©riologique) et comparées aux commentaires sur l'Evangile de Jean que l'on trouve chez Jean Chrysostome, st Augustin, Thomas d'Aquin, Nicolas de Lyre, Erasme, Zwingli et Bullinger. Cependant, Thimothy Wengert considère le texte de Melanchthon avant tou comme une oeuvre littéraire de grand impact, et en étudie l'aspect le plus fort et le plus original, sa théorie de la rhétorique et de la dialectique.
